文章展示
标题：表观遗传免疫编辑驱动胶质母细胞瘤免疫逃逸
时间：/04/29
单位：爱丁堡大学
期刊：Cell（IF38.）
平台：RNA-seq、RRBS、WGS、K
摘要：多形式胶质母细胞瘤（GBM）是一种侵略性脑肿瘤，目前免疫治疗也难以派上用场。这篇文章中，研究人员主要探讨了GBM中的免疫逃避机制。通过连续将GBM干细胞（GSC）移植到免疫功能强的宿主中，来建立增强的免疫抑制性肿瘤微环境，发现GSC通过增强免疫抑制性肿瘤微环境来逃避免疫清除反应。该反应不是通过肿瘤亚克隆的基因选择而引起，而是通过表观遗传免疫编辑过程诱发的，在收到免疫攻击后，GSC的转录和表观遗传发生变改变。这些变化启动了骨髓相关转录应答，增加肿瘤相关巨噬细胞的招募。此外，研究人员在人类间质亚型GSC中找到了类似的表观遗传和转录特征。结果表明，表观遗传免疫编辑可能通过重塑肿瘤免疫微环境，在最具侵袭性的间充质GBM亚型中驱动获得性免疫逃逸程序。
标题：microRNA表达和DNA甲基化共同驱动乳腺癌的激素依赖表型
时间：/04/29
单位：奥斯陆大学
期刊：GenomeMed（IF10.）
平台：K、microRNA芯片
摘要：DNA甲基化异常是乳腺癌发病的早期事件。然而，这种改变是如何产生的仍然鲜为人知。microRNA在转录后水平上调节基因表达，并在各种生物过程中发挥关键作用。这篇文章中作者将miRNA表达和CpGs的DNA甲基化关联，以研究miRNA如何影响乳腺癌的甲基化水平，以及DNA甲基化如何调节miRNA表达。文章中通过miRNA-甲基化数量性状位点（mimQTL）分析，关联了来自两个乳腺癌人群——OSLO2（n=）和TCGA（n=）的miRNA表达和DNA甲基化数据。对mimQTL的聚类分析确定了不同的miRNA和CpGs分组，这些组反映了与乳腺癌发病机理相关的重要生物过程。值得注意的是，两个主要的miRNA簇与免疫或成纤维细胞渗透有关，而另一个簇与雌激素受体（ER）信号有关。研究与雌激素信号相关聚类簇的CpGs甲基化水平发现，该聚类中的miRNA可能通过抑制DNA甲基化酶的水平调节FOXA1、GATA2和ER-alpha的表达。此外，在雌激素簇中，miR-29c-5p与DNA甲基转移酶DNMT3A的mRNA和蛋白质表达呈负相关。结果表明，在乳房病变早期可能存在miR-29c-5p调控ER阳性乳腺癌的DNA甲基化异常。
标题：神经精神疾病对人脑区域特异性甲基化区域的影响
时间：/04/22
单位：约翰霍普金斯大学医学院
期刊：GenomeBiol（IF10.）
平台：WGBS
摘要：大脑中的DNA甲基化变化与脑发育和神经精神疾病有关，大脑功能不同的区域DNA甲基化水平也有所不同。先前对人脑不同区域甲基化差异的研究中所取的样本数量有限或只