作者：解螺旋·子非鱼
如需转载请注明来源：解螺旋·医生科研助手
导语DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是近年来新的研究热点之一。这个可以从国自然中标的结果看出。加上近来对甲基化在肿瘤中重要性的报道，想必这一热潮还有待持续。你是不是也对它垂涎已久，却苦于无从下手，其实甲基化的研究其实并没那么难，一句话，还是套路。
随着高通量测序技术（NGS）技术的发展，使我们能够从全基因组水平来分析5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件，由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西，这就是所谓的“DNA甲基化测序”！
DNA甲基化测序方法按原理可以分成三大类：
1、重亚硫酸盐测序；
2、基于限制性内切酶的测序；
3、靶向富集甲基化位点测序；
DNA甲基化测序常用方法基于以上原理又有数种不同的测序方法，下面，就介绍10种DNA甲基化测序的常用方法及参考文献：
1)重亚硫酸盐测序
该方法可以从单个碱基水平分析基因组中甲基化的胞嘧啶。首先，利用重烟硫酸盐对基因组DNA进行处理，将未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基变成尿嘧啶。而发生了甲基化的胞嘧啶未发生脱氨基，因而，可以基于此将经重亚硫酸盐处理的和未处理的测序样本进行比较来发现甲基化的位点。
ShotgunbisulphitesequencingoftheArabidopsisgenomerevealsDNAmethylationpatterning.
Highlyintegratedsingle-baseresolutionmapsoftheepigenomeinArabidopsis
2）重亚硫酸盐处理后接头标记技术(PBAT)
为了避免重亚硫酸盐处理时模板的丢失，通常会在重亚硫酸盐处理后进行接头连接和随机引物的扩增。
Amplification-freewhole-genomebisulfitesequencingbypost-bisulfiteadaptortagging